Der erste Hinweis auf eine Otitis ist in der Regel der Schiefkopf, der mit einem ansonsten meist eher guten Allgemeinbefinden einhergeht. Unter dem Otoskop erscheinen die Schleimhäute des Ohres geschwollen und gerötet. Zusätzlich kann sich sichtbar Flüssigkeit im Ohr sammeln. Bei einer Entzündung des Mittelohrs kann das Trommelfell durch Flüssigkeitsansammlungen dahinter vorgewölbt sein.
Auf dem Röntgenbild erscheint die Otitis als Schatten auf der Knochenblase.

Der Nachweis der Erreger ist am lebenden Tier oft nicht möglich.  In der Literatur wird zwar die Punktion der Knochenblase (Bulla tympanica) erwähnt. In der Praxis ist das gerade an kleineren Mausarten aufgrund der geringen Größe schwierig bis unmöglich und wird nicht angewendet. Denkbar zur Bestimmung von Erregern ist eher ein Abstrich, wenn Sekret aus dem Ohr abfließt.

Der Schiefkopf wird von Tierärzten oft als Schlaganfall oder als Befall mit E. cuniculi diagnostiziert. Schlaganfälle sind meiner Erfahrung nach bei Mäusen aber sehr selten. Auch E. cuniculi kommt bei Mäusen nur sehr selten vor. In der Regel sind dann Nager betroffen, die engen Kontakt zu typischen Trägern, also Kaninchen, hatten. Neoplasien können vor allem bei Farbratten eine alternative Ursache für die Symptome sein. Das Cholesteatom betrifft als weitere mögliche Ursache vor allem Mongolische Rennmäuse.