Der Effekt des in Lotagen enthaltenen Wirkstoffes Policresulen beruht auf seiner eiweißfällenden Eigenschaft. Es denaturiert die oberen Epithelschichten von Haut oder Schleimhaut und regt dabei Regenerationsprozesse an.
Bei glatten Muskelfasern löst Lotagen eine Kontraktion aus. Es wirkt deshalb auch auf Schleimhäuten adstringierend. Kleinere Gefäße ziehen sich durch diesen Vorgang zusammen. So entsteht der blutungsstillende Effekt von Lotagen.

Lotagen wirkt durch den denaturierenden Effekt bakterizid (in Konzentrationen von 0,15 – 0,20 mg/ml). Bei Bakterien greift Policresulen sowohl die grampositiven, als auch die gramnegativen Arten an. Außerdem bekämpft es Trichonomaden bei einer Konzentration von 14 – 15 mg/ml, ohne gesundes Gewebe zu schädigen. Die Sporen von Bakterien tötet es allerdings nicht ab. Ebenso besteht nur eine ungenügende bis gar keine Wirksamkeit bei Pilzen. Auch bei Hefen ist es nur begrenzt wirksam.

Lotagen lässt pathologisch verändertes oder abgestorbenes Gewebe, Sekrete und Schleim gerinnen und hilft so, krankhaft veränderte Gewebeteile selektiv ab- und herauszulösen, ohne gesundes Gewebe zu schädigen.

Vorteil des Wirkstoffes ist es, dass es aufgrund seines Wirkungsmechanismus nicht zur Bildung von Resistenzen kommen kann.

Außerdem ist seine Toxizität gering. Auch nach oraler Gabe ließen sich im Tierversuch keine Schäden an Leber, Niere und Milz feststellen. Bei der lokalen Anwendung sind Lösung und Konzentrat nicht toxisch.